Die iGPU kann auch transcoding. Haben gerüchteweise einige zum Laufen bekommen.
Wahrscheinliche Ursache deines Problems ist aber dass sich durch einstecken der GPU die Topologie des PCIe-Busses ändert, sprich die NIC hat eine andere Busnummer.
Damit ändert sich die enpxxx Nummer und die config passt nicht mehr.